16S/18S/ITS测序及宏基因组测序
16S宏基因组测序常常采用高通量扩增子测序技术来检测微生物16S rRNA基因的特定高变区。16S MetaVx™是安升达公司独立研发的微生物菌群高通量测序平台，适用于环境微生物、肠道菌群等样品的细菌和古细菌相对丰度的鉴定。16S MetaVx™体系采用多套引物同时扩增细菌和古细菌的V3、V4和V5 三个可变区，大幅提高当前16S宏基因组学技术的灵敏度和特异性。与常用的16S宏基因组学检测方法相比，16S MetaVx™能够检测出更多的痕量的细菌和古细菌。
除了细菌和古菌的高通量检测，安升达也提供针对真菌和原生生物的菌群检测服务，主要包括ITS测序和18S测序两种。18S测序主要鉴定真菌及其他原生生物，适用于浮游微生物、土壤微生物等环境微生物，以及共生的真核生物菌群等。而ITS测序主要鉴定真菌，如果样品以真菌为主，或者仅关注样品中的真菌菌群，可以选择ITS测序。请联系安升达获得关于ITS测序和18S测序的详细信息。
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服务选项
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16S MetaVx™ （不含真核生物）
环境样品16S MetaVx™测序，使用两个扩增子检测16S基因的V3、V4和V5三个可变区，其中一个扩增子分析V3/V4区，另一个扩增子分析V4/V5区。该项服务适于检测真核生物DNA含量较低的样品。
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16S MetaVx™ （含真核DNA）
哺乳动物16S MetaVx™测序，采用一个扩增子检测16S基因的V3和V4可变区。该项服务适于检测真核生物DNA含量较高的样品，此扩增体系去掉了与真核18S基因同源性较高的V5区。
服务优势
技术细节
相对于目前已有的宏基因组16S鉴定平台，安升达开发的16S MetaVx™测序平台兼具保守性和灵活性，能够覆盖绝大部分细菌菌群，并同时鉴定细菌和古菌。比常规的16S检测更加灵敏，并且更能反映真实的菌群组成和结构。
使用16S MetaVx™测序平台和常用的16S V4区高通量测序平台，在相同条件下，同时对相同的样品进行扩增测序。测序完成，将数据进行归一化。比对结果如下:
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图1 16S MetaVx™ Vs 常规16S测序
模拟测试样品，16S MetaVx™平台检测出19个纲的微生物，而常规16S测序仅检测出11个纲。*仅被16S MetaVx™平台检出。**占菌群80%左右，上图未包含。
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图2 增加V5区显著提高菌种检出率
16S MetaVx™测序平台增加了V5可变区检测，能够比单单检测V3V4可变区在不同的物种分类层级上多鉴定出10-15%的菌种。
安升达16S/18S/ITS测序及宏基因组测序流程
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实验设计
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目标区域富集
&文库制备2 -
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高通量测序
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微生物特性分析
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安升达宏基因组学样品提交指南
安升达的宏基因组学项目可以针对土壤、粪便、空气、水体、动植物体表和体内等任何来源提取的全基因组DNA进行检测，除了已纯化的基因组DNA，也可以提供土壤、粪便、液体和组织等样品。如需获得更详细的样品提交要求，请访问我们的样品提交指南页面。
安升达16S/18S/ITS测序及宏基因组测序服务标准交付
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