sgRNA细胞内脱靶检测——GUIDE-advance
随着CRISPR基因编辑疗法发展得如火如荼,对于CRISPR技术安全性的评估也变得越来越重要。为了提高CRISPR技术的安全性,检测CRISPR的脱靶风险,以及筛选出最安全的sgRNA序列,在临床实验中就显得至关重要。
为帮助科研人员寻找sgRNA的脱靶位点,安升达自主开发了一种新的细胞内脱靶检测方法——GUIDE-advance,改善了传统GUIDE-seq的假阳性、插入效率低等问题,是一种灵敏度高、特异性好,并且可以同时分析多个sgRNA的检测方法。
金唯智提供的CRISPR/Cas9技术服务的授权来自Broad研究所。应用场景
服务优势
可信度高——可以发现细胞内真实发生的CRISPR脱靶切割位点
灵敏度高——相较于GUIDE-seq,提高了检测脱靶位点的灵敏度
通量高——多个sgRNA的检测可以组合进行,降低了检测成本
假阳性低——相较于GUIDE-seq,降低了dsODN随机插入导致的假阳性
应用广——不局限于spCas9,其他CRISPR系统,如AsCas12a/LbCas12a等,或者TALEN/ZFN也可应用
服务内容
项目 | 内容 | 周期 | 价格 | 交付形式 |
GUIDE-advance (单个sgRNA) |
sgRNA合成与细胞转染+基因组鉴定+建库+测序分析 | 20-30个工作日 | 8500元 | 原始数据+可视化结题报告 |
GUIDE-advance (多个sgRNA) |
sgRNA合成与细胞转染+基因组鉴定+建库+测序分析 | 20-30个工作日 | 询价 | 原始数据+可视化结题报告 |
- 您需提供细胞,如第一次提供将产生一定的细胞检测与测试费用
- 基因组打靶鉴定、凝胶电泳和毛细管电泳QC,切割效率>5%认为切割效率合格
应用示例
对GUIDE-advance与GUIDE-seq进行比对,针对同一个spCas9 sgRNA,在相同二代测序数据量的条件下,GUIDE-advance在靶位点和脱靶位点的reads数大约是GUIDE-seq的2倍,并且能够找到更多的脱靶位点。相对于传统方法,GUIDE-advance大大提升了脱靶检测的灵敏度与特异性。