基因组De novo测序
全基因组de novo测序(de novo sequencing)也称为从头测序，不需要任何基因序列信息即可对某个物种进行测序，用生物信息学的分析方法对序列进行拼接、组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。
安升达基于三代测序PacBio技术手段，对动植物基因组进行组装和基本分析，同时结合BioNano光学图谱，提升组装版本，获得高质量基因组序列，为该物种的基因组学研究奠定基础。
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安升达基因组de novo测序服务参数
| 标准服务 | 升级服务 | |
| 技术参数 | PacBio(50X)+BioNano(100X) | PacBio(70X)+BioNano(100X) |
| 分析软件 | SMRT Link / Falcon / Canu | SuperGenome |
| 组装指标 | Contig N50>200K，Scaffold N50>1M | Contig N50>5M，Scaffold N50>10M |
安升达基因组de novo测序服务优势
根据不同的项目需求设计不同的实验方案
利用SuperGenome升级组装，使Contig N50长度提升5~10倍
针对不同物种选取合适的分析软件及流程
SuperGenome分析结果展示
将已发表的玉米、水稻及人的数据，利用SuperGenome重新组装，在保证拼接完整性、不丢失基因组序列的前提下，Contig数目减少，Contig N50长度提升5~10倍。
SuperGenome分析结果展示
将已发表的玉米、水稻及人的数据，利用SuperGenome重新组装，在保证拼接完整性、不丢失基因组序列的前提下，Contig数目减少，Contig N50长度提升5~10倍。
| Rice Nagia22 | Maize B73 | Human HX1 | ||||
| Published | SuperGenome | Published | SuperGenome | Published | SuperGenome | |
| N | 912 | 56 | 2,790 | 706 | 5,915 | 1,454 |
| N:n50 | 112 | 10 | 506 | 54 | 103 | 25 |
| N:n90 | 450 | 27 | 1,613 | 190 | 536 | 122 |
| Min | 3.336 | 82031 | 1,945 | 28,410 | 2 | 2,502 |
| N95 | 123,289 | 4,293,542 | 250,684 | 1,278,145 | 149,819 | 896,491 |
| N90 | 197,151 | 5,278,830 | 388,549 | 2,379,755 | 576,618 | 2,475,108 |
| N50 | 946,210 | 14,270,486 | 1,279,870 | 7,693,311 | 8,200,456 | 32,645,641 |
| Max | 3,538,062 | 31,640,606 | 7,264,800 | 44,889,389 | 38,177,111 | 108,215,793 |
| Sum | 362 Mb | 385 Mb | 2.1Gb | 2.1Gb | 2.89Gb | 2.89Gb |
SuperGenome分析结果展示
将已发表的玉米、水稻及人的数据，利用SuperGenome重新组装，在保证拼接完整性、不丢失基因组序列的前提下，Contig数目减少，Contig N50长度提升5~10倍。
SuperGenome分析结果展示
将已发表的玉米、水稻及人的数据，利用SuperGenome重新组装，在保证拼接完整性、不丢失基因组序列的前提下，Contig数目减少，Contig N50长度提升5~10倍。
生物信息学分析
| 基因组surcey | 基因组组装 | 基因组注释 |
|
基因组特征评估
|
组装结果评估 |
重复序列注释 基因结构注释 基因功能注释 非编码RNA注释 |
