「微生物信息分析培训班」圆满结束,精彩内容集锦来了!
8月9-11日,金唯智在苏州总部举办了“微生物信息分析培训班”,针对生物信息零基础的学员,进行了系统、全面的课程培训。尽管这两天最强台风“利奇马”来势汹汹,苏州园区也启动了防御台风Ⅲ级应急响应,但依然挡不住小伙伴们对知识的渴望哇!
紧凑的课程安排、精彩的授课内容……微生物信息分析培训班的这三天可谓是干货满满!不妨一起来回顾下本期培训班的精彩内容吧!
1. 金唯智,基因组学研究的助推器
开班仪式上,金唯智中国市场部总监万乐人进行了欢迎致辞,为大家介绍了金唯智的发展历程以及服务概况,并分享了自己的一些行业感悟。
金唯智成立于1999年,经过二十年的发展,现已形成了围绕“读基因”、“写基因”、“编基因”的一站式基因组学全球服务网络。在高通量测序服务领域,金唯智拥有先进完备的测序平台、智能化的生物信息分析平台、强大的数据分析能力以及多项实验创新和专利,可为科研人员在基因组学研究、精准医疗及等众多领域提供最全面的解决方案。
市场部总监万乐人提到:“我们的宗旨就是让大家的科学研究成本更低、效率更高,多快好省的帮助大家完成相关工作。‘帮助他人就是帮助自己’,这也是金唯智二十多年来依然蓬勃发展的重要原因,希望我们能够成为基因组学研究的助推器,真正地帮助生命科学研究一步一步的往前走。”
2. 课程内容,干货满满
在这三天时间里,紧凑的课程安排、精彩的授课内容、贴心的一对一教学等,都博得了各位学员的认可,也让学员们收获了丰富的专业知识。
安艳秋:高通量测序技术应用介绍
针对微生物测序中常见的几种方法,如微生物多样性、宏基因组及宏转录组等,进行了原理及应用介绍,并通过多篇文献分享,介绍了微生物多组学的应用。
肖桂鹏:微生物高通量测序技术概论
课程详细讲述了高通量测序中的各个实验环节,包括样品制备时的注意事项,样品提取的常用方法,微生物多样性的扩增方法、引物设计,基因组文库的构建方法,二代及三代的测序原理等。
车玉隆:Linux基础培训
Linux系统的稳定性、安全性和可操作性非常适合二代测序大数据分析,所有生信分析都是在Linux远程服务器下进行。该部分课程重在讲解Linux的常用命令和进阶编辑,以实操为主,从数据库下载公共数据后的存储压缩、查找文件,将Linux下黑白的数据展示转化为Window系统下的图形展示模式。
陈启欣:Qiime2介绍及操作
Qiime2软件是微生物多样性分析中使用频率较高的一款软件,可以用于数据QC、物种注释、α及β多样性分析等,解决多样性分析中的大部分需求,课程详细介绍了Qiime2软件的使用方法,并进行了上机操作,系统的学习了微生物菌群多样性的分析流程。
李洁:微生物多样性结题报告解读
针对微生物多样性结题报告进行了详细解读,从拿到结果如何快速查找结果,到表格及图片如何解读都进行了详细说明。
王玲:微生物多样性云平台介绍及操作
金唯智依托阿里云自主研发的微生物多样性云平台-MetaAnalyzer,让客户可以自主进行数据挖掘,可操作性强、适用度高。本次课程从功能及实操两方面对云平台详细了进行介绍,解决多样性分析中的售后问题。
江岩:菌群多样性测序分析流程设计及与环境因子的关联分析
微生物群落的研究以菌群多样性的应用最为广泛,从分析流程开始入手,详细介绍了16S/18S/ITS分析流程,通过α多样性获取菌群中的物种信息及丰度分布,β多样性分析组间菌群差异。另外,针对环境因子分析,介绍了常见的几种分析方法,及如何利用Cytoscape软件进行网络图绘制进行了分享。
段海蓉:宏基因组测序分析流程设计及菌群多样性功能预测分析
宏基因组作为了解菌群基因功能的研究手段之一,在现在的研究中应用越来越广泛。课程介绍了宏基因组分析中的常见分析流程及软件,并通过分享宏基因组的两篇案例,为大家解读了宏基因组中的方案设计及分析流程。此外,针对微生物多样性中的功能预测分析,介绍了几种常见软件,并利用PICRUSt2软件进行了上机操作,帮助大家更好的学习。
安利伟:单菌基因组测序分析流程设计及STAMP作图
由于三代测序的长度长、无GC偏好性及可识别碱基修饰等优势,为细菌完成图的组装提供了很大的便利,本次培训详细介绍了单菌基因组组装的常用软件及应用。
STAMP是一款物种分类学及代谢组学分析软件,其包含了全面完整的统计学方法,能够对组间及样本间的差异进行检测并进行输出,同时还能够生成高质量的结果图。课程中为大家分享了STAMP软件的使用方法并进行了软件实操。
3.现场参观-基因组学中心实验室
为了让学员们全面了解文库构建和上机测序,本期培训班特为学员安排了金唯智高通量基因组学中心实验室的参观之行。在讲师的带领下,学员们参观了金唯智高通量基因组学中心实验室。从样品收发、样品制备、样品检测到核酸保存、文库构建,再到摆满了NovaSeq、MGISEQ-2000、HiSeq X Ten等各种测序仪器的测序实验室,系统而详细的介绍让学员们对高通量测序有了更全面的认知。
通过直观的接触不同测序设备和技术平台,观摩研究Illumina、Pacbio等测序平台的芯片构造,学员们更清晰直观的了解了建库和测序原理。
4.学员评价,培训学习涨新知
课程结束后,我们收到了学员们的真诚反馈,很多学员表示收获满满,同时也给了我们很多改进建议。
看到大家对金唯智培训课程的肯定和期待,我们感到非常荣幸。今后,金唯智也会根据大家的反馈进行课程优化,举办更加优质的培训课程,为大家提供更好的科研服务!