金唯智引进华大MGISEQ-2000，高通量测序服务再上新台阶！



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金唯智已正式引进华大智造生产的MGISEQ-2000国产高通量测序仪，多平台协同服务，为广大的科研工作者提供更多高效、精准、更高性价比的高通量测序服务。目前，我们已经完成首批数据测试，下面让我们来学习下MGISEQ-2000的测序原理，一睹基于此平台的WGS、WES和转录组实测下机数据吧。

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人全基因组实测数据展示
 
一、 重测序（hWGS）数据分析
 
采用同一个人基因组样本，分别基于MGISEQ-2000 和HiSeq 平台进行PE150测序。
1. 下机数据质量对比结果

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从实测图来看，MGISEQ-2000的read1、read2数据质量表现都很好，read2没有出现明显质量下滑现象。
 
 2. 数据Mapping及突变检测表现

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从实测数据来比较，MGISEQ-2000展示的Unique reads数量更多，Duplicates rate更低。另外，与已知参考突变数据集相比，其一致性较高。
 
二、全外显子（hWES）测序数据分析
 
采用4个不同的人样本（GW146/GW158/GW181/GW216），利用MGISEQ-2000和HiSeq同时对其进行WES检测
 
表2  下机数据及比对统计

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小结：
 
a、测序质量高：MGISEQ-2000整体数据质量与HiSeq一致，且read1与read2质量基本一致，更为均匀；
b、Duplicates rate 低：减少数据浪费，数据使用率更高；同时，也意味着InDel、CNV等突变检测将更加精准；
c、MGISEQ-2000能检测到更多已知变异数据集的数据，尽管差异不大，意味着MGISEQ-2000数据包含了更多可靠的变异相关信息；
d、外显子覆盖更全面：相近数据量下，MGISEQ-2000可以覆盖更多的外显子区域。
 
真核有参转录组数据展示
 
我们旨在为您提供优异的测序数据，以下测试结果选自4个小鼠样本，分别用MGISEQ-2000和HiSeq测序。
 
1. MGISEQ-2000的下机数据质量展示

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2. 基因表达量相关性分析
 
从基因表达量来看，MGISEQ-2000和HiSeq两种测序结果相关性很高。

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图4  相关性分析结果     
 
3. 鉴定率与现主流平台一致率高
 
表达的基因数目总数相差不大，共同表达的基因数目占所有表达基因94%以上。

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   图5 >94%鉴定到的基因与HiSeq平台一致
* 注：以上测试结果不代表最终承诺结果。
小结：
 
a、测序质量高：无论是测序质量，还是Map质量，MGISEQ-2000皆保持了高质量的产出，产出数据稳定性好；
b、Duplicates rate 低：低Duplicates rate，意味着RNA-Seq下机数据能呈现出更接近真实情况的基因表达；
c、基因表达与鉴定：测序成本较低的情况下，MGISEQ-2000与主流平台（HiSeq）的RNA-Seq结果保持了高度一致性。
 
MGISEQ-2000测序平台总结

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关于金唯智高通量测序平台
早在2011年，金唯智就推出高通量测序服务。为给客户提供更全面的测序服务，金唯智平台逐步提升，建立了高效的高通量测序平台和高性能生物信息分析平台。
2016年，金唯智引进Illumina HiSeq X Ten 及最新的单分子基因测序系统 PacBio Sequel。
2017年，金唯智第一时间引进了Illumina NovaSeq 6000测序仪。
此外，金唯智还配备Illumina MiSeq、10X GENOMICS等测序平台。
此次引进华大智造MGISEQ-2000测序仪 ，金唯智的基因组学研究平台将更加全面、高效，不仅为客户提供多种测序读长、通路和时间周期选择，更可满足各类科研及应用对成本和速度的差异化需求。

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通过多平台的协同服务，结合自主研发的智能化生物信息分析平台、雄厚的科研技术力量、全球化的运营管理以及卓越的服务优势，金唯智将为客户提供具有价值的服务，在基因组学研究、精准医疗与其它应用领域的研究提供最全面的基因组学解决方案。
目前，金唯智汇集了国内外优秀的高通量测序和生物信息分析专家学者，依托高水平的设备平台，在基因组学、转录及表观遗传调控、微生物组学等多组学领域构建了金唯智特色服务，形成了独特的二代测序与三代测序相结合的一站式解决方案，并与国内外众多高校院所和研发机构开展广泛的科研合作，赢得了众多合作伙伴的高度认可。