单细胞Flex转录组测序
10x Genomics 的 Single Cell Gene Expression Flex 是一种依托特异性探针杂交原理开发的新型单细胞转录组测序技术。该技术突破传统测序依赖完整 RNA 的局限，通过全面优化细胞捕获、裂解反应与核酸捕获体系，大幅提升复杂样本的适配能力。以往常规单细胞测序难以处理的各类特殊样本，包括临床稀缺的罕见病患者组织、长期留存的生物存档样本，以及经 PFA 固定细胞或FFPE 样本等，均可借助该方案稳定完成检测。凭借高灵敏的探针捕获机制，有效降低降解 RNA 带来的干扰，稳定输出重复性佳、完整性高的转录组数据，极大拓宽了单细胞测序的样本应用边界，为临床样本回溯研究与疑难疾病机制探索提供有力技术支撑。
技术流程
技术原理
1. 样本固定与RNA锁定
Flex 技术使用 4%多聚甲醛（PFA）固定细胞或组织样本，锁定 RNA 的表达状态，使其在 -80℃下可稳定保存数月，而不会影响后续测序质量。该技术特别适用于 FFPE 样本（福尔马林固定石蜡包埋组织），通过脱蜡和酶消化处理，将其解离成单细胞核悬液进行测序。
2. 探针杂交捕获RNA
Flex 不依赖传统的 polyA 捕获（如常规单细胞 3′ RNA 测序），而是采用预先设计的探针组（针对人和小鼠约 18,000‑19,000 个基因）进行杂交捕获。探针由 LHS（左臂）和 RHS（右臂）组成，分别结合目标 RNA 的上下游序列，增强特异性。
3. 建库与测序
杂交后的探针在微流控芯片（如 Chromium X）中被 Gel Beads 捕获，进行连接、延伸和扩增，构建测序文库。
10x Flex数据展示
通过对比10x Flex与3’转录组的实际测试数据，可以发现，在多种样本类型下，使用相同测序数据量时，Flex技术能够获得更高的测序数据饱和度，展现出更强的探针灵敏度，使得单个细胞内能够检测到的基因数量显著增加。
