第二届「基因编辑培训班」圆满结束，精彩内容回顾！

8月16日-18日，来自全国各大高校、研究所等科研机构的学员们来到金唯智苏州总部参加了暑期培训班系列之「基因编辑培训班」。

为期三天的培训班包含了CRISPR基因编辑技术原理应用、CRISPR Screen案例解析、生信必备分析实战等核心内容。理论课程与上机实操相结合，为学员提供了全面系统的学习方式，让学员快速掌握基因编辑技术及相关研究方法，助其解锁CRISPR研究。

1. 金唯智，基因组学服务的助推器

金唯智中国总经理吴昕博士为本次培训班进行了欢迎致辞，对远道而来的学员们表示热烈欢迎，同时为大家介绍了金唯智的发展情况。

在全面的一二三代测序服务（读基因），和丰富的基因合成服务（写基因）基础上，金唯智隆重推出了基因编辑一站式服务（编基因），可为科研工作者提供从sgRNA设计、到后期细胞筛选、数据分析的一站式服务。

CRISPR技术的发现让基因编辑更加方便、高效，应用范围也越来越广泛。吴昕博士表示：“希望通过这三天的培训，我们能够真正帮助大家进入到这个领域，让大家对基因编辑定义、应用方向、实验操作、数据分析以及研究课题的开展等方面都有更清晰的认知、更明确的答案。”

2. 课程内容的回顾总结

丰富的课程内容，详细的知识解读，以及手把手的信息实战，得到了学员的充分认可，也让学员们收获颇丰。

刘同欣：CRISPR基因编辑技术的发展及应用、高通量基因编辑的原理、应用与设计

CRISPR基因编辑技术的发展及应用：课程详细介绍了基因编辑技术CRISPR的原理、CRISPR/Cas9基因编辑的应用及脱靶效应等，同时，从sgRNA构建、到细胞转染、筛选和测序对细胞单基因编辑流程做了详细的说明。高通量基因编辑：讲师着重介绍了高通量基因编辑的原理及流程，高通量基因编辑在构建过程中注意的事项，常见的问题及应用方向，为初学者提供了入门基础。  

薛高旭：微生物基因编辑

讲师首先介绍在CRISPR/Cas9基因编辑技术应用之前，大肠杆菌常用的基于温敏开关的IN-OUT和 λ Red介导的基因替换技术，然后讲解了将CRISPR/Cas9技术用于大肠杆菌和酵母系统进行基因编辑的技术方法和难点，重点介绍了在大肠杆菌体内引入CRISPR/Cas9系统，同时引入HR或NHEJ系统，大肠杆菌对Cas9切割的基因组进行同源重组修复或非同源末端修复，以及使用单链和双链DNA作为修复模板的不同方法。

陈业：在基因敲入中合理的使用ssDNA技术

讲师先是介绍了基因组功能研究的常见方法，即：正向研究和反向研究。然后讲解了ssDNA在基因编辑敲入中的用途，和传统的质粒模板在效率以及特异性等方面做了全面的比较。ssDNA在敲入效率，随机插入等方面都显著优于质粒模板。最后介绍ssDNA的不同合成方法以及各自优缺点。

谢正立：病毒载体在基因编辑中的应用

课程回顾了慢病毒的一代、二代、三代的发展，慢病毒包装的原理和使用方法，并讲解了慢病毒/腺相关病毒作为基因递送的优势，腺相关病毒和慢病毒载体应用和设计技巧、以及在基因编辑中的应用。慢病毒可以做为基因传递的媒介用于绝大部分细胞的转染，和脂质体转染相比，在转染效率方面相比具有明显的优势。

包海声：NGS原理与CRISPR样本建库测序方法探秘

课程先是介绍基于Illumina仪器的NGS测序原理，以及CRISPR Screen建库方法和文库样本的质控标准，包括一步法建库和两步法建库等，同时比较了一步法和两步法的优缺点。针对不同的样品（细胞，PCR产物等），讲解了不同的处理方法。

肖芳：常用生信软件与数据格式解析及操作

课程介绍了生物信息分析常用的软件以及如何进行Fastq等格式数据解析，实际操作使用MAGeCK进行CRISPR Screen数据分析。

陈楠：Linux操作系统与常用命令实践

课程介绍了生信分析最常用的操作系统Linux，以及Linux中目录及文件操作相关的基础命令例如目录切换、文件创建、权限更改等。课程最后结合了实例，从复制到解压到最后文件统计，详细讲解了linux系统中最常见的文件处理流程，为Linux初学者提供了全面的基础教学。

苏春明：Python及其在NGS数据分析中的应用、CRISPR Screening分析方法揭秘、测序数据质控与gRNA文库质检分析

课程以初学者的角度介绍了Python语言，分析了Python的数据类型，并以此法分析了gRNA文库的质检分析、gRNA的序列提取、gRNA比对和统计、基因筛选与注释等。同时也详细讲解了CRISPR Screen的分析方法。

李珉：CRISPR Screening数据处理脚本解析、CRISPR Screening结题报告解读

课程从脚本运行、脚本解析、结果分析三个步骤介绍了CRISRP Screen数据处理的脚本，同时从项目介绍、质控分析、sgRNA技术比对、差异分析、高级分析等多个方面对金唯智的CRISPR Screen的结题报告做了解读。

3.基因组学中心实验室的参观之行 

基因编辑技术与高通量测序的结合，可以让研究者更快速高效的得到实验结果，亦能在很大程度上拓宽该技术的应用，比如药物靶标的快速发现与验证等。为了让学员更好地了解基因编辑脱靶检测以及CRISPR Screen的样本文库构建和上机测序实况，本次培训班也为学员准备了金唯智高通量基因组学中心实验室的参观之行。

在基因组学中心实验室，从样品收发、样品制备、样品检测到核酸保存、文库构建，再到摆满了NovaSeq、MGISEQ-2000、HiSeq X Ten等各种测序仪器的测序实验室，资深实验员的系统讲解让学员们对高通量测序有了更全面的认知。

此外，通过直观的接触不同测序设备和技术平台，观摩研究Illumina、Pacbio等测序平台的芯片构造，学员们对建库及测序原理也有了更清晰的认知。

4.好评与期待满满的学员评价

所有课程的精心筹备只为了能让参与培训的学员们在有限的时间里能真正有所收获。看到大家对金唯智培训课程的肯定和期待，我们感到非常荣幸。

每期培训班结束后，我们都会根据学员的反馈不断总结经验、优化课程内容。今年的暑期培训课程虽已全部结束，但服务无期限，我们依然会与大家保持紧密联系，如果大家在今后的研究中遇到一些问题，欢迎及时反馈，我们会在学员群里一一解答哦。