复杂结构测序

由于二级结构、高GC含量以及其他内在因素的影响,复杂结构对于测序是巨大的挑战。常规的测序方案往往容易出现提前中断或者测序结果紊乱的现象。

以下几种序列特点的样品适合针对复杂结构的测序方案:

  • 高GC含量:GC含量> 60%的模板,或者局部高GC含量的模板
  • 发夹结构:包含两个反向重复序列,两个重复序列之间间隔至少3个碱基
  • 重复序列: 2个或3个碱基的多个连续重复

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模版示例

小发夹RNA(shRNA)模板测序

RNA干扰(RNAi)是指双链RNA(dsRNA)介导的特异性抑制某相关基因表达的一种机制。它逐渐发展为一种研究基因功能的快速有效的新兴技术。

RNAi模板,由于其存在 “发卡结构”,给测序工作带来了很大挑战。在RNAi研究中采用的小发卡RNA(shRNA)通常无法测序成功,测序结果往往提前中断或者信号紊乱。金唯智拥有专门针对shRNA模板的测序方案,测序结果得到客户的一致认可。

从下图您就可以看出该项技术的优越性:

重复序列/高GC含量模板测序

重复序列/高GC含量模板具有特殊的二级结构和解链温度。包含高GC含量和发夹结构的DNA相对更难变性,对测序构成非常大的挑战。

金唯智利用特有的技术,可以成功地对高GC含量模板以及具有其他特殊二级结构的模板进行测序。

 


服务优势

先进的技术
金唯智拥有专门针对复杂模板的测序方案,测序结果得到客户的一致认可。
个性化方案
金唯智的技术支持团队为您的项目需要提供个性化的科学咨询和定制解决方案。
优质的技术支持
我们的技术支持会和您一起讨论项目进展,解答您的疑问。周六、周日为您提供系统发送测序结果和回复紧急邮件的服务。