RNA干扰(RNAi)是指双链RNA(dsRNA)介导的特异性抑制某相关基因表达的一种机制。它逐渐发展为一种研究基因功能的快速有效的新兴技术。
RNAi模板,由于其存在 “发卡结构”,给测序工作带来了很大挑战。在RNAi研究中采用的小发卡RNA(shRNA)通常无法测序成功,测序结果往往提前中断或者信号紊乱。安升达拥有专门针对shRNA模板的测序方案,测序结果得到客户的一致认可。
从下图您就可以看出该项技术的优越性:
重复序列/高GC含量模板具有特殊的二级结构和解链温度。包含高GC含量和发夹结构的DNA相对更难变性,对测序构成非常大的挑战。
安升达利用特有的技术,可以成功地对高GC含量模板以及具有其他特殊二级结构的模板进行测序。