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盛夏荷塘花开,一起来pick微生物生信培训班的精彩内容!



盛夏荷花开,学习正当时! 8月10日至12日,金唯智迎来了微生物信息分析培训班的学员们。三十多位小伙伴欢聚一堂,共同探讨微生物基因组学与生物信息学的奥秘。

本期培训班课程涵盖了高通量测序技术原理及进展、Linux命令和R语言绘图、菌群多样性和宏基因组测序解读、经典案例分享和数据挖掘等诸多内容。接下来,小编就带领大家一起来回顾下本次培训班的精彩内容。

 

金唯智-基因组研究的助推器

 

开班仪式上,金唯智中国执行总经理吴昕博士进行了致辞,同参加此次培训班的学员们分享了自己在生命科学领域的行业感悟,同时详细介绍了金唯智的发展情况。

吴昕博士2018年微生物培训班开班致辞

吴昕博士开班致辞,介绍金唯智的一站式基因组学服务

金唯智旨在为全球生命科学领域的研究人员提供高效率、高质量的基因组学解决方案,加快他们的研究进展。依托分布在全球的15个卫星实验室,金唯智形成了围绕“读基因”、“写基因”、“改基因”的一站式基因组学全球服务网络,并建立了良好的行业口碑和服务优势。

在高通量测序服务领域,金唯智拥有Illumina HiSeq X Ten、PacBio Sequel等完备的测序平台、智能化的生物信息分析平台、强大的数据分析能力,同时通过自主研发和合作开发更高效的测序流程,形成了独特的技术优势。

吴昕博士表示“近年来,生物信息学蓬勃发展,我们特别期待这三天的课程能真正的帮助到大家,让每个人都学有所获,学有所用”。未来,通过BT+IT技术的深入结合,金唯智也非常期待能为科研人员带来更多的便利。

 


精彩课程概要

 

高通量测序前沿进展及微生物测序技术概论

周乾-高通量测序微生物产品经理

随着测序技术的高速发展,三代测序技术的应用得到越来越广泛的应用,该部分课程从三代测序原理出发,详细介绍了三代测序技术的优势及应用。课程涵盖微生物多样性、宏基因组及单菌的基因组组装,更有样品制备、文库构建、上机测序、信息分析及应用等诸多方面,系统的展示了微生物的解决方案。

 

Linux基础培训

潘兵-基因组产品线生物信息分析高级工程师

Linux系统的稳定性、安全性和可操作性非常适合二代测序大数据分析,所有生信分析都是在Linux远程服务器下进行。该部分课程重在讲解Linux的常用命令和进阶编辑,以实操为主,从数据库下载公共数据后的存储压缩、查找文件,将Linux下黑白的数据展示转化为Window系统下的图形展示模式。

 

菌群多样性介绍及Qiime软件实操

江岩-微生物产品线生物信息分析高级工程师

微生物群落的研究以菌群多样性的应用最为广泛。讲师从分析流程开始入手,详细介绍了16S/18S/ITS分析内容,通过α多样性获取菌群中的物种信息及丰度分布,β多样性分析组间菌群差异;最后利用Qiime软件上机操作,系统的学习了微生物菌群多样性的分析流程。

 

宏基因组结题报告解读及经典案例分享

段海蓉-微生物产品线生物信息分析总监

宏基因组是了解菌群基因功能的研究手段之一。为使学员更好的学习,从基础出发,先对结题报告及结果进行了详细解读,并对宏基因组分析中的常用软件进行了简单介绍。最后,通过分享宏基因组的两篇案例,为大家解读了宏基因组中的方案设计及多组学应用。

 

单菌基因组基础培训

安利伟-微生物产品线生物信息分析高级工程师

当我们分离培养出某一未知单菌后,想要了解它的结构及功能,就需要进行单菌的基因组组装,获取基因组信息,并通过功能预测及注释,了解其功能基因。由于三代测序的长度长、无GC偏好性及可识别碱基修饰等优势,为细菌完成图的组装提供了很大的便利。本次培训详细介绍了组装的常用软件及应用,并对组装结果进行了详细解读。

 

R语言简介及数据实操

郑钦-微生物产品线生物信息分析高级工程师

R语言可将获取的数据集进行统计及可视化分析,对于高通量测序获取的大量数据而言,R的应用就更加不容忽视。R作为一个完整的工具集,有超过5000个可用数据包,本次培训便简单为学员介绍了如何利用ggplot2绘制散点图、直方图等常用图片。

 


 

丰富的课程内容,一对一的专业指导,理论与上机相结合,学员们在收获学识的同时更是收获了美好的回忆。

 

微生物课堂学员认真学习

认真听课、相互交流的学员们

微生物课堂学员认真学习2

授课老师指导实操演练

 


 

参观高通量基因组学中心实验室

 

全面的了解文库构建和上机测序, 直观的接触不同测序设备和技术平台,有助于学员更好的理解数据的生成以及后续的数据分析处理。

参观高通量基因组学中心实验室

在金唯智高通量基因组学中心实验室,学员们参观了HiSeq X Ten 和 NovaSeq等先进的测序平台,观摩了Illumina测序平台的核心部件FlowCell芯片的构造,更清晰直观的了解了建库和测序原理。

 


学员评价

 

为期三天的培训,课程紧张而充实,令小编非常感动的是很多老师每天早早地就来到了培训地点,或预习新课或复习旧知。相信大家的努力,最终都会化成科研的硕果!一起来看看大家都怎么说

微生物学员评价1

微生物学员评价2

微生物学员评价3

微生物学员评价4

非常感谢各位小伙伴们的肯定与鼓励,我们也会秉承初心、不断改进完善,为大家提供更优质的课程;当然金唯智也将以更高的责任感和使命感,搭建更加全面完善的基因组技术服务平台,为科研人员提供更加优质的服务!