sgRNA细胞内脱靶检测——GUIDE-advance

随着CRISPR基因编辑疗法发展得如火如荼,对于CRISPR技术安全性的评估也变得越来越重要。为了提高CRISPR技术的安全性,检测CRISPR的脱靶风险,以及筛选出最安全的sgRNA序列,在临床实验中就显得至关重要。

为帮助科研人员寻找sgRNA的脱靶位点,安升达自主开发了一种新的细胞内脱靶检测方法——GUIDE-advance,改善了传统GUIDE-seq的假阳性、插入效率低等问题,是一种灵敏度高、特异性好,并且可以同时分析多个sgRNA的检测方法。

金唯智提供的CRISPR/Cas9技术服务的授权来自Broad研究所。

应用场景

服务优势

可信度高——可以发现细胞内真实发生的CRISPR脱靶切割位点
灵敏度高——相较于GUIDE-seq,提高了检测脱靶位点的灵敏度
通量高——多个sgRNA的检测可以组合进行,降低了检测成本
假阳性低——相较于GUIDE-seq,降低了dsODN随机插入导致的假阳性
应用广——不局限于spCas9,其他CRISPR系统,如AsCas12a/LbCas12a等,或者TALEN/ZFN也可应用

服务内容

项目 内容  周期 价格   交付形式

GUIDE-advance

(单个sgRNA)

 sgRNA合成与细胞转染+基因组鉴定+建库+测序分析 20-30个工作日 8500元 原始数据+可视化结题报告

GUIDE-advance

(不超过4个sgRNA)

 sgRNA合成与细胞转染+基因组鉴定+建库+测序分析 20-30个工作日 18500元 原始数据+可视化结题报告
                                                 
  • 您需提供细胞,如第一次提供将产生一定的细胞检测与测试费用
  • 基因组打靶鉴定、凝胶电泳和毛细管电泳QC,切割效率>5%认为切割效率合格

 

应用示例

对GUIDE-advance与GUIDE-seq进行比对,针对同一个spCas9 sgRNA,在相同二代测序数据量的条件下,GUIDE-advance在靶位点和脱靶位点的reads数大约是GUIDE-seq的2倍,并且能够找到更多的脱靶位点。相对于传统方法,GUIDE-advance大大提升了脱靶检测的灵敏度与特异性。

 

细胞内脱靶检测_1027

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